- Vezető: Prof. Pongor Sándor
- Tagok: Dr. Juhász János, Dr. Ligeti Balázs
- Kapcsolat: pongor.sandor@itk.ppke.hu
- A csoport érdeklődésének hagyományos tárgya a bioinformatikai adatok általános elmélete. Ennek lényege az, hogy a bioinformatikai adatokat, azaz a szekvenciákat, a 3D molekulaszerkezeteket, a biológiai hálózatokat és genomokat és a tudományos szövegeket közös elméleti keretben, a rendszerelmélet és a hálózatkutatás módszereivel írjuk le. Ezáltal a biológiai adatok és adatbázisok kezelésének közös alapelvei jobban megérthetők, ami azért fontos, mert ezáltal értelmezni tudjuk a biológiai közösségek adatait, pl. a metagenomikai adatokat is. Csoportunk egyik súlyponti feladata a tantárgyfejlesztés BSc, MSc és PhD kurzusok számára, melynek három fő iránya a bioinformatika alapjai, a tudományos adatok vizualizációja, valamint az adatértelmezés és kommunikáció, vagyis a közleményírás, előadástartás. Mindezt új fénybe helyezi a mesterséges intelligencia megjelenése, amelyhez tantárgyfejlesztéseink is alkalmazkodnak. Projektjeink másik része az elsősorban élőlényekhez köthető mikrobiomok elemzéséhez kötődik. Ezek összetételének, kapcsolatainak vizsgálatára és ábrázolására dolgozunk ki módszereket.
A molekuláris biológiai adatok különböző rétegeit (például nukleotidszekvenciák, 3D-s fehérjeszerkezetek, biológiai funkciók) össze kell kapcsolni ahhoz, hogy (tudományos cikkekben közzétett) ismereteket szerezzünk a szervezetek szerkezetéről és szabályozásáról. A különböző adattípusok vagy rétegek közötti leképező eszközök és a rétegeken belüli klaszterezési módszerek kulcsfontosságúak a hatékony információátvitelhez.
