A doktori iskolában a doktoranduszok munkáját a témavezető szervezi és irányítja.
Egyes projektek és/vagy szakterületek irányítására a témafelelős a doktorandusszal egyetértésben konzulenst kérhet fel. A projektek kidolgozásának anyagi erőforrásait a központi támogatáson túl a kutatási szerződések biztosítják, valamint a Jedlik Laboratórium saját erőforrásai.
A képzés színvonalát meghatározzák a már működő nemzetközi kapcsolatok, amelyek szoros együttműködést jelentetnek a Kaliforniai Berkeley Egyetem, az Indiana-i Notre Dame Egyetem, a Leuven-i Katolikus Egyetem és a Sevilla-i Egyetem megfelelő Laboratóriumaival, ezenkívül mintegy tíz további Laboratóriummal, közös munka illetve projekt szintű együttműködések révén.
