Karunk kutatási együttműködésekben vesz részt az alábbi hazai intézményekkel:
- Bay Zoltán Alkalmazott Kutatási Közhasznú Nonprofit Kft.
- ELTE Társadalomtudományi Kutatóközpont
- HUN-REN Állatorvostudományi Kutatóintézet
- HUN-REN Energiatudományi Kutatóközpont
- HUN-REN Kísérleti Orvostudományi Kutatóintézet
- HUN-REN EK Műszaki Fizikai és Anyagtudományi Kutatóintézet
- HUN-REN Rényi Alfréd Matematikai Kutatóintézet
- HUN-REN Számítástechnikai és Automatizálási Kutatóintézet
- HUN-REN Szegedi Biológiai Kutatóközpont
- HUN-REN Természettudományi Kutatóközpont
- HUN-REN Wigner Fizikai Kutatóközpont
- HUN-REN Ökológiai Kutatóközpont
- Nemzeti Népegészségügyi és Gyógyszerészeti Intézet
- Országos Onkológiai Intézet
