Tantárgy adatlapja

Tárgy neve: Biostatistics
Tárgy kódja: P-ITMAT-0040
Óraszám: N: 2/2/0, L: 0/0/0
Kreditérték: 5
Az oktatás nyelve: angol
Követelmény típus: Kollokvium
Felelős kar: ITK
Felelős szervezeti egység: Pázmány Péter Katolikus Egyetem Információs Technológiai és Bionikai Kar
Tárgyfelelős oktató: Dr. Juhász János
Tárgyleírás:

Tantárgy neve:Biostatistics
P-ITMAT-0040
Tárgyfelelős:Juhász János
Tantárgy oktatója:Juhász János
A tantárgy céljának rövid ismertetése:A tantárgy célja a statisztikai elemzések elméleti és gyakorlati alapjainak átadása, a biológiai jelenségek, adatok vizsgálata során felmerülő kiértékelési, adatelemzési alapok bemutatása.
Elsajátítandó elméleti ismeretanyag:
  • Adatok leírása, redukciója, reprezentációja
  • Adat eloszlások normál (Gaussi) eloszlás, Z-score, konfidenciaintervallumok,
  • A centrális határeloszlás-tétel, arányok kezelése
  • Hipotézisvizsgálat, szingifikanciaszint, p-érték, első- és másodfajú hiba, hatáserősség, minta mérete
  • Cohen-féle d. Kísérlettervezés Normalitás tesztek, adattranszformációk, log, logit
  • Parametrikus és nemparametrikus tesztek, kontingenciatáblázatok, arányok összehasonlítása
  • Chi-négyzet teszt, Fisher-teszt, Osztályozás, ROC görbe Többszörös összehasonlítások és korrekcióik, ANOVA
  • Korreláció, zavaró hatások, regresszió: lineáris, többszörös, logisztikus
  • Túlélési elemzés: élettábla, Kaplan-Meier módszer, Cox modell
Elsajátítandó gyakorlati ismeretanyag:Az elméleti ismeretek alkalmazása konkrét példa adatsorok R környezetben történő elemzésével. A gyakorlati feladatok során a hallgatók az RStudio mellett Python nyelvű kódokat (Jupyter notebook) is használnak.
A 2-4 legfontosabb kötelező irodalom felsorolása bibliográfiai adatokkal (szerző, cím, kiadás adatai, (esetleg oldalak), ISBN):Andy Field, Jeremy Miles, Zoë Field: Discovering statistics using R. Sage, 2012. ISBN: 9781446200469.
Ken A. Aho: Foundational and applied statistics for biologists using R. CRC Press, 2014. ISBN: 9781439873380.
A 2-4 legfontosabb ajánlott felsorolása bibliográfiai adatokkal (szerző, cím, kiadás adatai, (esetleg oldalak), ISBN):Thomas.W. MacFarland, Jan.M. Yates: Using R for Biostatistics. Springer, 2022. ISBN: 9783030624064.
Monika Wahi, John C. Pezzullo: Biostatistics for Dummies. For Dummies, 2024. ISBN: 9781394251469.
Elmélet-gyakorlat aránya:Elméleti óra óraszáma: 2
Gyakorlati óra és labor óra óraszáma: 2 + 0
Az alkalmazott oktatási módszerek:
  • Előadás vetített prezentációval
  • Moodle felületen közzétett feladatok
  • PC teremben programozás
Az értékelés módja:
Az értékelés kritériuma:Az előadások mellett instruktor által vezetett programozási gyakorlatok, kiadott házi feladatok, adatelemzési projektfeladat segíti az anyag elsajátítását
Miként járul hozzá a tantárgy a KKK-ban megjelölt kompetenciaelemek megszerzéséhez:

Bioinformatika mesterképzés:
A2: A bemutatott biostatisztikai alapok és R alkalmazások ismerete jelentős mértékben hozzájárul a bioinformatikai megvalósítások létrehozásához
A4: A kurzus az adatelemzési módszerek statisztikai vonatkozásainak megértéséhez járul hozzá
B2: A megfelelő statisztikai szempontok ismerete lényeges eleme a bioinformatikai eljárások tervezésének, releváns eredményeket adó munkafolyamatok kialakításának
B3: A bemutatott statisztikai eljárások a kritikus adatértelmezés egyik legfontosabb pillérét jelentik
B4: A statisztikai szemlélet és ismeretek jelentős mértékben járulnak hozzá a szakmai véleményformáláshoz
B5: A statisztikai alapok biztos ismerete hozzájárul újszerű elemzési technikák megvalósításához
C4: A statisztikai elemzéseket integráló kritikus gondolkodás a mások által elért eredmények értékelésének lényeges eleme
D1: A megbízható önálló munkavégzéshez szükséges a saját és mások által elért eredmények objektív statisztikai elemzésének képessége

A tárgy az alábbi képzéseken vehető fel

bioinformatika IMNI-ABI mesterképzés (MA/MSc) Nappali angol 4 félév ITK
info-bionika mérnöki IMNM-AIB mesterképzés (MA/MSc) Nappali angol 4 félév ITK
orvosi biotechnológia IMNI-AOB mesterképzés (MA/MSc) Nappali angol 4 félév ITK
szechenyi-img-alt