Tantárgy adatlapja
Tárgy neve: Integrated Structural Bioinformatics
Tárgy kódja: P-ITBIO-0028
Óraszám: N: 1/0/2, L: 0/0/0
Kreditérték: 4
Az oktatás nyelve: angol
Követelmény típus: Kollokvium
Felelős kar: ITK
Felelős szervezeti egység: Pázmány Péter Katolikus Egyetem Információs Technológiai és Bionikai Kar
Tárgyfelelős oktató:
Dr. Gáspári Zoltán
Tárgyleírás:
Structural representations of macromolecular structures, the Protein Data Bank and the PDB file format. Quality assessment of experimentally solved macromolecular structures. Assignment of secondary structural elements in 3D structures. Detection of domains. Algorithms for 3D structure comparison and alignment, structural classification databases. Predicting protein function from structure, identifying functionally important residues and contacts. Introduction to protein structure prediction methods, from ’1D’ to full 3D predictions. Basics of protein:ligand docking. Inclusion of internal dynamics in structural representations. Principles of protein design.
