Tantárgy adatlapja

Tárgy neve: Introduction to Bioinformatics
Tárgy kódja: P-ITBIO-0009
Óraszám: N: 2/2/0, L: 0/0/0
Kreditérték: 5
Az oktatás nyelve: angol
Követelmény típus: Kollokvium
Felelős kar: ITK
Felelős szervezeti egység: Pázmány Péter Katolikus Egyetem Információs Technológiai és Bionikai Kar
Tárgyfelelős oktató: Dr. Pongor Sándor
Tárgyleírás:

A tárgy elméleti és gyakorlati bevezető a bioinformatikába. A kurzus során szó lesz a tudományterület elméleti hátteréről és megismerjük az informatika néhány fontos alkalmazási területét a biológiában különös tekintettel a DNS és fehérje szekvenciák elemzésére. Elmélyedünk a bioinformatika alapfogalmaiban (pl.: hasonlóság, hasonlósági mértékek, adat aggregáció, projekció), az illesztési technikákban (lokális, globális, páronkénti, többszörös), a hasonlóság keresésben (BLAST) és a filogenetikát is érintjük. Elsajátítjuk néhány fontos bioinformatikai adatbázis használatát (pl.: az NCBI szolgáltatásait). Végül pedig megismerkedünk az újgenerációs szekvenálás (NGS) és a funkcionális genomika alapkoncepcióival, a kapcsolódó jellemző bioinfomatikai feladatokkal (pl.: szekvencia összeállítás, annotálás, variáns keresés) és néhány korszerű elemzési módszerrel, eszközzel is. 

A tárgy az alábbi képzéseken vehető fel

mérnökinformatikus MSc IMNI-AMI mesterképzés (MA/MSc) Nappali angol 4 félév ITK
molekuláris bionika mérnöki BSc IANI-MB alapképzés (BA/BSc/BProf) Nappali magyar 7 félév ITK
szechenyi-img-alt