Tantárgy adatlapja

Tárgy neve: Quantitative Biology
Tárgy kódja: P-ITBIO-0052
Óraszám: N: 2/0/0, L: 0/0/0
Kreditérték: 2
Az oktatás nyelve: angol
Követelmény típus: Kollokvium
Felelős kar: ITK
Felelős szervezeti egység: Pázmány Péter Katolikus Egyetem Információs Technológiai és Bionikai Kar
Tárgyfelelős oktató: Dr. Csikász-Nagy Attila István
Tárgyleírás:

Tantárgy neve:Quantitative Biology
P-ITBIO-0052
Tárgyfelelős:Csikász-Nagy Attila István
Tantárgy oktatója:Csikász-Nagy Attila István
A tantárgy céljának rövid ismertetése:A kurzus célja a sejt-, molekuláris és evolúcióbiológiai folyamatok és jelenségek matematikai leírásának megalapozása, példák bemutatása konkrét kutatások, elemzések kapcsán. A cél a biológiai modellek felállításának és alkalmazásának megismertetése, hozzájárulva a rendszerbiológiai, de általában a bioinformatikai elemzések értő módon történő alkalmazásához.
Elsajátítandó elméleti ismeretanyag:A kurzusba bevont előadók mindegyike aktívan részt vesz kísérletes kutatásokban és azok eredményeinek elemzésében. A különböző európai intézményekből érkező kutatók többek között egyedi sejtes vizsgálatokról, mikrofluidikáról, hosszú távú evolúciós kísérletekről, a COVID dinamikájáról, a sejtmozgások dinamikájáról tartanak előadásokat. A konkrét tudományos munkafolyamatok megismerése révén a legújabb irányzatokba és megközelítésekbe nyernek bepillantást.
Elsajátítandó gyakorlati ismeretanyag:A hallgatók megismerkednek a sejtnövekedés R alapú modellezésével, valamint egyes témakörökhöz tartozó kísérleti elrendezések gyakorlati megvalósításának aspektusaival.
A 2-4 legfontosabb kötelező irodalom felsorolása bibliográfiai adatokkal (szerző, cím, kiadás adatai, (esetleg oldalak), ISBN):Michael E. Wall (szerk), Quantitative biology: from molecular to cellular systems Taylor & Francis. 2012., ISBN: 9781439827222
Daniel A Beard, Hong Qian: Chemical biophysics : quantitative analysis of cellular systems. Cambdóridge University Press , 2006, ISBN: 978052158244
A 2-4 legfontosabb ajánlott felsorolása bibliográfiai adatokkal (szerző, cím, kiadás adatai, (esetleg oldalak), ISBN):Josef Hofbauer, Karl Sigmund: Evolutionary games and population dynamics. Cambridge University Press, 2002, ISBN: 9780521625708
Mark C. Leake: Single-molecule cellular biophysics. Cambridge University Press, 2013, ISBN: 9781107005839
Elmélet-gyakorlat aránya:Elméleti óra óraszáma: 2
Gyakorlati óra és labor óra óraszáma: 0 + 0
Az alkalmazott oktatási módszerek:
  • Előadás vetített prezentációval
  • Moodle felületen közzétett feladatok
Az értékelés módja:Kollokvium
Az értékelés kritériuma:Frontális előadás, instruktor által vezetett programozási gyakorlat, szakirodalom megbeszélése “journal club” rendszerben. Minden hallgató tart előadást egy kiválasztott cikkből, és a félév végén áttekintjük a feldolgozott témákat.
Miként járul hozzá a tantárgy a KKK-ban megjelölt kompetenciaelemek megszerzéséhez:

Bioinformatika mesterképzés:
A1: a hallgatók a journal club keretében angol nyelven vitatják meg a kiadott szakmai anyagokat
A3: a hallgatók valós kutatási példákon, első kézből ismerik meg az összetett rendszerek működését és azok vizsgálati módszereit
B1, B4: a journal clubok során a hallgatók kritikusan elemzik a szakmai anyagokat, egymás véleményét is megismerve
B3: A valós esettanulmányok során a hallgatók találkoznak a kísérletek értékelésének aspektusaival
B4: A journal clubok fejlesztik a hallgatók szakmai vitakészségét, kritikai hozzáállását
B7: A bemutatott eredmények révén a hallgatók képet kapnak az alkalmazott megközelítések biotechnológiai és egészségügyi vonatkozásairól
B8: az előadókkal és egymással történő beszélgetések során a hallgatók mélységében megértik a bemutatott kutatások alapjait és összefüggéseit
B9: A journal clubok során a hallgatók gyakorlják a szakirodalom feldolgozását és értelmezését
C2, C3, C4:: az oktatóktól és hallgatótársaktól folyamatos visszajelzéseket kapnak a megértésük szintjéről a journal clubok keretében is, inspirálva szakmai fejlődésüket
D2: a journal clubok során megtanulják egymás véleményét figyelembe venni, a társak látásmódját értékelni és beépíteni, valamint aktívan segíteni egymásnak a szakmai problémák feldolgozásában

A tárgy az alábbi képzéseken vehető fel

bioinformatika IMNI-ABI mesterképzés (MA/MSc) Nappali angol 4 félév ITK
info-bionika mérnöki IMNM-AIB mesterképzés (MA/MSc) Nappali angol 4 félév ITK
nemzetközi program INNX-XNP Nemzetközi program képzése Nappali angol 1 félév ITK
orvosi biotechnológia IMNI-AOB mesterképzés (MA/MSc) Nappali angol 4 félév ITK
szechenyi-img-alt