Vezető: Prof. Gáspári Zoltán
Tagok: Dr. Dobson-Kálmán Zsófia Etelka, Jakab Borbála, Szalainé Ágoston Bianka
Kapcsolat: gaspari.zoltan@itk.ppke.hu
A kutatócsoportban fehérjemolekulák szerkezet-funkció összefüggéseit vizsgáljuk kísérletes és számításos módszerekkel. A kísérletes vizsgálatok fókuszában az idegi jelátvitelben, ezen belül is a tanulás és memória molekuláris szintű folyamataiban fontos szerepet játszó posztszinaptikus denzitás egyes komponensei állnak. Ezek között globuláris, fibrilláris és funkcionálisan rendezetlen szakaszok is megtalálhatóak. Az általunk kiválaszott, biotechnológiai úton előállított fehérjeszakaszok szerkezetét és partnerkötését különböző biofizikai módszerekkel jellemezzük, beleértve hazai és nemzetközi együttműködések segítségével végzett NMR-spektroszkópiai méréseket.
Egyik legfontosabb megközelítési módunk ezen NMR adatok molekulamodellezési eljárásokkal való kombinálása, illetve azok segítségével történő értelmezése. További kiemelt területünk a magányos alfa-helikális fehérjeszakaszok (single alpha-helixes, SAHs) vizsgálata, melyek detektálását és általános előfordulásának jellemzését bioinformatikai módszerekkel végezzük. A posztszinaptikus denzitásban fontos szerepet játszó, aktinkötő Drebrin fehérje magányos alfa-hélix szakaszát pedig kísérletes és molekulamodellezési eljárások segítségével vizsgáljuk.
A Drebrin magányos alfa-helikális (SAH) régiójának sokaságalapú szerkezeti modellje (60 konformer). A modellt NMR és kisszögű röntgenszórás (SAXS) adatokra támaszkodva állítottuk elő. Alul a konstsukció szekvenciája, a kisbetűs szakasz az expressziós címke maradványa. A pozitív töltésű aminosavak (Arg, Lys) kék, a negatív töltésűek (Asp, Glu) piros színnel vannak jelölve a a szekvenciában és a szerkezetekben is.
Jövőbeli kutatási irányok, együttműködési lehetőségek
Örömmel veszünk részt a posztszinaptikus denzitás fehérjéinek kísérletes és elméleti vizsgálatát célzó projektekben. Kiemelten érdeklődünk fehérjék integrált szerkezetmodellezése iránt. A magányos alfa-hélixet (SAH) tartalmazó fehérjék eddig nem jellemzett csoportjai, új funkciói kapcsán is nyitottak vagyunk új együttműködésekre.
