Tantárgy adatlapja

Tárgy neve: Scientific Python
Tárgy kódja: P-ITSZT-0063
Óraszám: N: 0/0/2, L: 0/0/0
Kreditérték: 3
Az oktatás nyelve: angol
Követelmény típus: Gyakorlati jegy
Felelős kar: ITK
Felelős szervezeti egység: Pázmány Péter Katolikus Egyetem Információs Technológiai és Bionikai Kar
Tárgyfelelős oktató: Dr. Novák Borbála
Tárgyleírás:

Tantárgy neve:Applications of Machine Learning in Biotech and Medtech
P-ITSZT-0063
Tárgyfelelős:Horváth András
Tantárgy oktatója:Horváth András
Iván Kristóf
A tantárgy céljának rövid ismertetése:A tantárgy célja a hallgatók számára betekintést nyújtani a korszerű gépi tanulási módszerek biomedicinális alkalmazási területeibe, valós példákon bemutatva.
Elsajátítandó elméleti ismeretanyag:A kurzus célja a gépi tanuláson alapuló, orvosi és biotechnológiai alkalmazások bemutatása. Ide tartozik a funkcionális motívumok azonosítása nagy szekvenciahalmazokban, a genomszintű asszociációs vizsgálatok, a biológiai hálózatok elemzése, beleértve a metabolikus útvonalakat és az idegi kapcsolatokat, valamint az idegi jelek és az orvosi képek feldolgozása. A kurzus folyamán hangsúlyos a problémák pontos leírása, a tanító és teszt adathalmazok kiválasztása és az eredmények kritikus értelmezése.
Elsajátítandó gyakorlati ismeretanyag:A gyakorlatokon a hallgatók konkrét alkalmazásokat ismernek meg, pl. Python nyelvű megvalósításokat. A hangsúly a munkafolyamatok egészének összeállításán és megértésén van, valamint az eredmények biológiai szempontú értelmezésén.
A 2-4 legfontosabb kötelező irodalom felsorolása bibliográfiai adatokkal (szerző, cím, kiadás adatai, (esetleg oldalak), ISBN):Abdulhamit Subasi: Practical guide for biomedical signals analysis using machine learning techniques: a MATLAB based approach. Elsevier, 2019. ISBN: 9780128174449.
Saleh Alkhalifa: Machine Learning in Biotechnology and Life Sciences. Packt Publishing, 2022. ISBN: 9781801811910.
Shyamasree Ghosh, Rathi Dasgupta: Machine Learning in Biological Sciences: Updates and Future Prospects. Springer Nature, 2022. ISBN: 9789811688812.
A 2-4 legfontosabb ajánlott felsorolása bibliográfiai adatokkal (szerző, cím, kiadás adatai, (esetleg oldalak), ISBN):Bharath Ramsundar et al.: Deep Learning for the Life Sciences: Applying Deep Learning to Genomics, Microscopy, Drug Discovery. and More. O'Reilly, 2019. ISBN: 9781492039839.
Elmélet-gyakorlat aránya:Elméleti óra óraszáma: 1
Gyakorlati óra és labor óra óraszáma: 0 + 3
Az alkalmazott oktatási módszerek:géptermi gyakorlatok, elemzőszoftverek használata, önálló projektfeladat
Az értékelés módja:
Az értékelés kritériuma:Frontális előadások, gyakorlati demonstrációk kiadott kódok bemutatásával. Önálló feladatmegoldás kiválasztott probléma esetében.
Miként járul hozzá a tantárgy a KKK-ban megjelölt kompetenciaelemek megszerzéséhez:

Bioinformatika mesterképzés:
A2: A gépi tanulási eljárások konkrét alkalmazásainak bemutatása közvetlenül hozzájárul a hallgatók lehetséges megoldásokkal kapcsolatos ismereteinek bővüléséhez
B1: A konkrét példákon keresztül a hallgatók megismerik az alkalmazási lehetőségeket
B6: A hallgatók példákon keresztül ismerik megz összetett rendszerek leírásának, elemzésének és modellezésének gépi tanulással kapcsolatos aspektusait
B7: A bemutatott eljárások közvetlenül kapcsolódnak orvosi, biotechnológiai alkalmazásokhoz
B8: A valós példákon a hallgatók megismerik a teljes alkalmazási munkafolyamatokat az informatikai tervezéstől a biológiai relevanciáig
B9: a projektfeladat révén a hallgatók gyakorlolják a szakirodalom értő feldolgozását
C’: a bemutatott példák demonstrálják a gyakorlati alkalmazások magas szintű megvalósítását
C2: A korszerű kutatások és új eredmények megismerése inspirálja a hallgatókat további új, mélyebb ismeretek megszerzésére
C3: A projektfeladat készítésekor a hallgatók önállóan elemzik és értékelik a feldolgozott szakirodalomban leírt szakmai döntéseket
C6: A bemutatott példák mintaként szolgálhatnak a hallgatók későbbi munkája során fejlesztett és alkalmazott munkafolyamatokhoz
D2: A bemutatott példákon keresztül a hallgatók megismerik a munkafolyamatok felosztásának aspektusait

A tárgy az alábbi képzéseken vehető fel

bioinformatika IMNI-ABI mesterképzés (MA/MSc) Nappali angol 4 félév ITK
info-bionika mérnöki IMNM-AIB mesterképzés (MA/MSc) Nappali angol 4 félév ITK
kvantummérnök IMNM-AKVM mesterképzés (MA/MSc) Nappali angol 4 félév ITK
mérnökinformatikus IMNI-AMI mesterképzés (MA/MSc) Nappali angol 4 félév ITK
nemzetközi program INNX-XNP Nemzetközi program képzése Nappali angol 1 félév ITK
orvosi biotechnológia IMNI-AOB mesterképzés (MA/MSc) Nappali angol 4 félév ITK
szechenyi-img-alt